На Землю падает огромный метеорит, оказавшийся инопланетным космическим кораблем. Несмотря на гигантский рост и совершенное знание военного искусства, Зентреди исключительно уязвимы им незнакомы понятия «культура» и «любовь», и простая романтическая песня оказывается более мощным оружием, чем все боевые роботы экипажа «Макросса». 1999 год. На фоне войны развивается любовный треугольник главных героев пилота Ичидзё Хикару, его начальницы, капитана Хаясэ Мисы, и начинающей поп-исполнительницы Линн Минмэй. Чтобы быть готовыми к появлению его хозяев, земляне начинают изучать и восстанавливать системы корабля. Однако явившиеся пришельцы оказываются не владельцами корабля (названного «Макросс»), а их древними врагами. Главная пушка «Макросса» автоматически стреляет и начинается война землян и инопланетян гигантов Зентреди