Дети с измененными генами были быстрее, сильнее, намного умнее. Началась война между Координаторами, людьми с измененным генным кодом, и Натуралами, получившими свои способности от природы. Чтобы защитить своих друзей, он становится пилотом управляемого боевого робота GUNDAM. Сражается за то, чтобы прекратить бессмысленную войну. Человечество нашло способ настолько хорошо усовершенствовать организм на генном уровне, что подопытные превосходили обычных людей по всем параметрам. Сам Координатор, Кира не придает значения различию между Координаторами и Натуралами, и сражается на стороне тех, кого любит. Люди никогда не любили тех, кто сильно от них отличается. По случайности в эпицентре этой войны оказался подросток, Кира Ямато