На этот раз героям предстоит столкнуться с зловещей Империей Белой Кометы, цивилизации с галактики Андромеда, которая завоевывает всех на своем пути. Но смогут ли они одолеть противника против которого даже главное волновое орудие Ямато бесполезно?. Корабль Земли получает сигнал от женщины по имени Тереза о надвигающейся опасности. Старая команда Ямато вновь собирается и угоняет крейсер чтобы противостоять новому врагу. Год 2201, Земля почти восстановилась после войны с Гамилусом и начала экспансию на планеты солнечной системы