Только увидеть единую паутину мира можно, лишь собрав вместе все ниточки отдельных судеб. Есть определенная концепция бытия, которую хотят донести до зрителей, используя незамысловатую тинейджерскую историю. Поэтому сюжет Ноейн напоминает полотно, из которого постоянно лезут во все стороны нитки. Ноейн — аниме о некой взаимосвязи времен, о предопределенности и выборе, о памяти и забытом. Что есть жизнь в масштабах времени — мгновение между прошлым и будущим, границу между которыми способна очертить лишь наша память. Мир состоит из квантов, жизнь из воспоминаний, а картинка складывается из отдельных штрихов. Тем не менее, в Ноейн авторы попытались воплотить свою интерпретацию классической проблемы пространства-времени при том, что одноплановой сюжетной линии нет, как и одной конкретной идеи в нем нет