Городские власти намерены разместить на месте нахождения резервации захоронение токсичных отходов. Трое храбрых ниндзя — Роки, Колт и Там Там — вступают в отчаянную и неравную борьбу с администрацией городка, чтобы спасти от гибели небольшое индейское поселение и их друга Джо. Чтобы остановить беспредел, друзья должны найти отца Джо и секретный диск, содержащий информацию о неправомочных действиях «городских воротил»…